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大多数青年缺血性卒中和短暂性脑缺血发作是动脉粥样硬化影响大或中等动脉的栓塞性或血栓性后果，以及颅内小血管病或来自心脏的栓塞。少数病例是由于罕见的或不常见的病因。
青年脑卒中(年龄40岁)常见的和可能的病因如下:
一、脑栓塞(31%)：最常见的病因是栓子(31%)，通常为心脏源性。
1.心源性：常来自已知的心脏病变，栓子源自心脏结构性病变，常见于二尖瓣狭窄,其他包括修复性瓣膜和感染性心内膜炎;以及心律失常，房颤最常见。
2.反常栓子：必须有右向左的分流，包括:房间隔缺损(ASD)、室间隔缺损(VSD)伴右向左分流，卵圆孔未闭伴分流，肺动静脉畸形等。
3.其他来源：如主动脉粥样硬化斑块。
二、不明病因(27%)：是青年脑卒中第二位常见的病因，可能包括:
1.特发性。
2.偏头痛:称为偏头痛性脑梗死。
3.口服避孕药:尚未证实;口服避孕药加吸烟是可疑病因。偏头痛患者正服用口服避孕药可增加卒中的风险。
三、动脉病：可分为两类:
1.脑动脉粥样硬化(18%):
脂类沉积引起的血管腔狭窄。
2.非动脉粥样硬化性动脉病(19%):
提示为血管壁病变。
包括:
①动脉夹层;纤维肌性发育不良(中年女性最常见，颈内动脉);
②炎症性:如Takayasu动脉炎、其他中枢神经系统动脉炎;
③放射线引起的动脉病。
四、高凝状态：
许多患者可能与当时未诊断的高凝状态有关，是缺血性卒中不常见的病因，但目前对其认识逐渐增强，尤其在年轻人。
五、静脉血栓形成:
是青年脑卒中的可能病因。
